Le drapeau franco-nunavois a été adopté en 2002. Les couleurs (bleu et blanc) font référence au ciel arctique ainsi qu’à l’abondance de neige sur ce territoire.

Au centre du drapeau se trouve l’inukshuk (ᐃᓄᒃᓱ en inuktitut), une « statue de pierres à l’image de l’homme construite par les peuples autochtones du territoire, qui symbolise la présence humaine ». Ce dernier est situé sous une forme d’igloo.

Au pied de l’inukshuk, on retrouve une fleur de pissenlit qui représente la population franco-nunavoise. « À l’image de la francophonie canadienne et nunavoise, la fleur de pissenlit résiste, par son entêtement, aux coups et s’adapte à son environnement. Souple, le pissenlit se replie pour résister aux tempêtes, mais il redresse toujours la tête, fier de résister aux intempéries. »

Le drapeau est utilisé lors d’événements et de célébrations organisés par la communauté francophone du Nunavut.